新址是一栋由瑞士名建筑师马里奥·波塔（Mario Botta）所设计的现代化建筑，最突出的特征是一个高38公尺的圆柱形斑马纹大天窗，光线可直接由楼顶照射到底楼，采光良好。它标新立异的外形，不但彰显旧金山的艺术精神，也成为全世界摄影师追逐的目标，这是旧金山市政府斥资6000万美元所盖成的心血结晶。

馆内收藏着二十世纪具代表性的西方艺术家的作品，如“野兽派”的法国画家马蒂斯（Henri Matisse）、“普普画派”的美国画家安迪·沃荷（Andy Warhol ）、墨西哥女画家弗莉妲·卡荷洛（Frida Kahlo）等，另还收藏如名画家理查·狄班孔（Richard Diebenkorn）等加州本地杰出画家的画作。

旧金山现代艺术博物馆是马里奥·波塔最早设计的博物馆，也是他在美国的第一个作品。

博物馆的特色天窗内景图

整个建筑外立面铺有红褐色调的面砖，有着巨大天窗的圆塔，像是把建筑物中央的圆柱体斜着切开一样，(自然光线从这里泻入建筑内部)，仅在该圆柱体部分用黑白相间的斑马条纹来加以强调，完全对称的正立面洋溢着古典建筑中才能见到的那种沉稳情调。由于博物馆所处的地块三面被高层建筑包围，这使得他的作品在周围一群灰白色的物体中显得尤为突出。